密碼子的第一和第二個(gè)堿基分別按照標(biāo)準(zhǔn)的Watson-Crick方式與反密碼子的第三和第二個(gè)堿基配對，但是擺動(dòng)部位的堿基對之間可以發(fā)生許多非標(biāo)準(zhǔn)的堿基配對；G-U堿基對尤為重要，結(jié)構(gòu)上幾乎與標(biāo)準(zhǔn)的G-C堿基對相同。因此，一個(gè)特定的在第一個(gè)（擺動(dòng)）堿基位置是G的反密碼子，能夠與兩個(gè)對應(yīng)的在第三個(gè)堿基位置上是（）的密碼子配對。